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数据连接试验是诊断什么病

发布时间:2022-10-01 19:34:31

⑴ 诊断是否是肺结核,有哪些快速的方法

我是从事公共卫生方向的医生,我来回答一下。结核病是由结核分枝杆菌引起的慢性传染病,可侵及全身除牙齿和头发以外的所有内脏,以结核病最为常见。人体感染结核病后,不一定会发病。据估计,目前我国携带结核杆菌的细菌数量约为5亿左右。结核杆菌是一种机会性致病菌,在人体免疫功能正常的情况下,不会引起人体疾病。




肺结核作为一种传染病,主要通过空气传播,所以肺结核患者应戴口罩,同时也要注意与肺结核患者接触。结核病是一种机会性疾病,与人体的免疫状态密切相关,所以我们应该多锻炼身体,多做一些有助于提高免疫力的事情。这就是我的回答,谢谢大家! 如果您有任何问题,请留言。您也可以关注私信咨询,谢谢!


小编针对问题做得详细解读,希望对大家有所帮助,如果还有什么问题可以在评论区给我留言,大家可以多多和我评论,如果哪里有不对的地方,大家也可以多多和我互动交流,如果大家喜欢作者,大家也可以关注我哦,您的点赞是对我最大的帮助,谢谢大家了。

⑵ 诊断试验的联合应用有几种方法,不同方法对试验的真实性和预测值有何影响

  1. 真实性(validity)或准确性(accuracy)要求一项诊断试验具备能正确地鉴别某病例患和未患某病的能力。这种反映患病实际情况的程度称作真实性,亦称准确性。

  2. 2.可靠性(reliabiliy)、重复性(repeatability)或精密度(precision)是指一项诊断试验在完全相同的条件下,重复作时获得相同结果的稳定程度。在临床实践中,一般用符合率来表示可靠性。

  3. 3.预测值(predictive value)灵敏度和特异度是一项诊断试验的特征,在决定是否采用某项试验时应考虑这些特征。一旦采用了某项诊断试验,就要仔细考虑试验结果的意义。如获阳性结果,患某病的可能性是多少;若获阴性结果,未患某病的可能性是怎样?这就是预测值。阳性预测值是指试验阳性的病例中真阳性的比例;阴性预测值是指试验阴性的病例中真阴性的比例。

⑶ 简述诊断试验评价的主要指标。

诊断试验评价的主要指标有敏感度(Sen)、特异度(Spe)、误诊率、阳性预测值、阴性预测值、假阴性率、假阳性率、似然比、符合率、准确度。
诊断试验是主要应用于疾病诊断、疾病随访、疗效考核以及药物毒副作用的监测。临床医师但单凭经验难免不够稳妥诊断,如未能给患者及时有效的治疗,甚至造成不可弥补的损失。掌握科学的研究和评价诊断试验的方法可为其选择合理的诊断方法奠定基础,同时可避免单凭经验造成的错误。

2研究方法编辑
1须同标准诊断方法(金标准,gold standard) 进行盲法比较。标准诊断方法是指可靠的,公认的诊断方法,它能正确地区分有病和无病。临床上常用的标准诊断方法包括病理学检查,外科手术所见以及长期随访病例所获得的肯定结论。例如,诊断冠心病的标准诊断方法是冠状动脉造影,诊断肾炎的标准方法是肾组织活检和尸体解剖,诊断胆结石的标准方法是手术所见。具体作法是运用标准诊断方法,在“盲”的条件下将病例区分为实际有病和无病两组,再将待评价的诊断试验与相同病例诊断的结果作比较,然后列出四格表,就可得出真假阳性和真假阴性的结果,如表33-1所示,并计算灵敏度、特异度、预测值和正确指数等。
公式
2.被检查的病例要具备代表性,即要包括各临床型(轻、中、重型;有或无并发症者)病例。病例的代表性愈好,新的诊断试验的实用价值愈大。

3.选择对照。对照应在性别、年龄、某些生理状态等方面与病例保持均衡。对照不应只包括健康人,还应包括确实未患该病的其他病例以及确实未患该病但在临床上极易与该病混淆的其他病病例。

4.确定正常值。正常值的含义应说清,否则会直接影响正常值的数据。在正态分布时,正常值可用平均数±2SD表示。非正态分布时可用中位数或百分位数表示。绘制患病人群与未患人群诊断试验测定值的频数分布曲线时常有重叠。区别正常与异常的界限是否是最佳的临界点,将对诊断试验的灵敏度和特异度产生明显的影响。

5.要说明病例的来源。不同来源的病例对评价一项诊断试验有一定影响。这是由于不同人群某病患病率的差异对阳性预测值有影响。同时,对照的来源也应交待清楚。

⑷ ppd试验是什么

ppd试验是临床确诊结核病的重要指标。
对于不同的人群有不同的意义
(1)婴幼儿:常用于卡介苗接种的选择和监测。阳性时常表示已感染结核菌并产生抗体而不需要接种卡介苗;阴性时则应该及时接种卡介苗。未接种卡介苗的儿童,如果皮试呈强阳性时常表示体内有活动性结核灶,应及时进行结核菌检查、影像学检查、血沉等检查以确定诊断和治疗。
(2)成年人:因我国城镇中人口密集区成年居民的结核感染率很高,所以,如果ppd5单位试验阳性,仅表示有结核感染,并不一定患病;但呈强阳性时,常提示有活动性结核灶。因此,tb—ppd试验在诊断成人结核性疾病时诊断价值受限。
另外,在临床上有感染结核的确切依据而患者ppd试验却阴性,这种情况常见于以下疾病:初次感染结核菌4~8周以内、重度营养不良、恶性肿瘤、机体免疫缺陷性疾病(先天性免疫缺陷症、艾滋病)、免疫抑制剂使用者等,个别老年人因机体变态反应功能低下也常呈阴性反应。

⑸ 判断“糖尿病”, 看一下这个检测报告是否有糖尿病。请各位大侠

糖尿病的诊断标准:
正常空腹血糖的范围为3.15~6.19mmol/L,餐后血糖2小时血糖<7.8mmol/L,当空腹血糖≥7.0mmol/L,餐后2小时血糖≥11.1mmol/L为糖尿病;如果空腹血糖在6.1mmol/L~7.0mmol/L则称为空腹血糖损害。如果空腹血糖正常,餐后血糖在7.8mmol/L~11.1mmol/L则称为糖耐量减低。空腹血糖损害与糖耐量减低可看做从正常到糖尿病的一个过渡阶段,但如果治疗得当,可以逆转为正常。如果治疗不得当,则发展为糖尿病。
人体血糖正常浓度为:空腹静脉血浆血糖3.9~6.0mmol/L,餐后静脉血浆血糖<7.8mmol/L。
糖化血红蛋白的正常值是小于6.5%。糖化血红蛋白正常值:4.6~6.4。
葡萄糖耐量试验及馒头餐试验诊断糖尿病的标准:空腹血糖≥7.0mmol/L,2小时血糖≥11.1mmol/L,或任何时间的血糖≥11.1mmol/L,可以诊断为糖尿病。
有点重了,还有点并发症口渴、消瘦无力。只能怪你爸爸没有引起重视。现在后悔了。
糖尿病食谱
体重正常,无任何并发症者,从事重体力劳动,每日主食可适当放宽到300克(干的,指的是未煮熟的)以上。
儿童、孕妇、哺乳期妇女和营养不良者,主食250~300克。肉蛋类可增加至200~300克,烹调油40克,每日鸡蛋一个,牛奶250毫升或更多些。
肥胖伴有轻度并发症者或老年者,日主食限定在200~250克以内,蔬菜400~500克,肉蛋105克,烹调油30克。
经常吃点粗粮,最好是燕麦、荞麦、麸皮.多食用苦瓜。荤菜每餐100克(带骨)。保证每天的摄入营养够就行,适当多吃点蔬菜可充饥。
吃蔬菜吃阔叶类比小叶类好,小叶类的蔬菜比茎块类的蔬菜好,薯类(如山芋)要少吃,吃的话要适当减少主食。
吃荤菜吃两条腿(鸡)比四条腿(猪)的好,含脂肪少,没有腿的(鱼)比两条腿的(鸡)好。
加餐的话,在两餐之间,上午9点左右,下午4点左右。可用黄瓜、蕃茄,(可当水果吃)无糖饼干或不加糖饼干。
如果血糖控制得比较理想,稳定而无波动,空腹血糖控制在7.8mmol/L以下,饭后两小时血糖控制在10.0mmol/L以下,糖化血红蛋白在7.5%以下时,完全可以进食所喜欢的美味水果。饭后4小时吃点含糖量低的水果,有柚子、柠檬、西瓜、桃子、梨子、草莓、苹果。每人每天500克的蔬菜和水果,蔬菜400克,水果100克。100克苹果或橘子相当于12.5克主食.应从主食中减去12.5克.水果的重量包括与核的重量。如果每天吃200克的苹果,所产生的热量相当于吃主食的25克。
胆固醇的需要量,每人每天小于300毫克。一个鸡蛋的蛋黄刚好含有近300毫克胆固醇。所以每人一天吃一个鸡蛋蛋黄,正合乎营养要求。20粒花生米,40粒瓜子或是2颗核桃,就相当于10克纯油脂。吃了75克鱼肉就等于吃了25克瘦猪肉。200克的桃,相当于25克粮食产生的热能量。
饭菜一定要以清淡为主,少吃或不吃肥肉。每月每人的植物油用量,应限制在400—600克左右。
要控制血糖,必须控制饮食,坚持锻炼身体, 每天服药,定期监测血糖 ,并保持良好的心态,避免情绪有大的波动。
理想体重(公斤)=身高(厘米)-105。实际体重超过理想体重的10%就算超重。体重应控制在理想体重的±10%以内。
一般饭后1小时后运动为最佳。肥胖患者体重减轻的速度以每月体重下降1公斤左右为宜。
轻微强度的运动项目有:散步、站立乘车、简单的家务劳动持续30分钟左右。
步行、洗澡、下楼梯、做广播体操、平地骑自行车等,持续20分钟左右。这种强度的运动和持续时间,相当于消耗80千卡的热量。
中等强度的运动有:慢跑、上楼梯、坡路骑自行车、滑冰、打排球、登山等。持续10分左右。能消耗体内的热能80千卡。
大强度的运动有:长跑、跳绳、打篮球、举重、击剑等能持续5分钟左右,相当于消耗体内热量80千卡。
每天运动至少要消耗160千卡的热量,才能达到控制血糖和降低体重的目的。还要强调持之以恒。

⑹ 请教:肝昏迷的诊断标准是什么血氨的测定在其诊断中所处的地位在应激状态下,血氨是否会升高

在急性肝炎病情发展阶段,如出现神志改变或昏迷,则诊断比较容易。如肝硬化患者有明显肝功能失代偿的症状,或病史中有过门静脉分流手术,或近期有上消化道大量出血、感染、大量利尿、应用麻醉镇静药等诱因,肝性脑病的诊断也不难作出,此时如发现扑击样震颤和血氨增高,则可以肯定诊断 空腹动脉血氨比较稳定可靠,慢性肝性脑病尤其是门体分流性脑病多有血氨升高;急性肝衰竭所致的脑病,血氨多正常。 polanyi丁香园荣誉会员 -------------------------------------------------------------------- 同意kepple的意见。补充几点: 1、所问为肝昏迷还是肝性脑病?hepatic coma和hepatic encephalopathy(HE)在概念上还是有所不同。后者大于前者,按West Haven criteria分的0-4级,若有coma,已经是4级肝性脑病。此时,按kepple所提诊断依据较好。 2、若有已知有明确肝硬化或门脉高压及门体分流的基础,或急性肝衰竭,加上进展性脑病表现,扑击样震颤阳性,肝性脑病已可临床诊断。血氨增高有利于门体分流性HE诊断。 3、subclinical hepatic encephalopathy(SHE)在肝硬化患者中的发生率约30-84%。SHE由于通常仅有有智力检测和诱发电位的异常,而无脑病临床表现,常规的精神和神经功能检查正常。因此很容易被忽略。脑诱发电位不知道你那里有没有做。如果没有的话可使用一些智力测试试验,如数字连接试验、图画连接、数字符号试验和搭积木试验等来代替。虽然SHE还没有统一的标准,一般来说,智力试验及脑诱发电位中有一项以上异常者可以诊断SHE。特别要注意对有肝硬化或TIPPS等门体分流基础的患者,若智力试验提示异常,还是可以用乳果糖等进行试验性治疗的。 4、关于血氨测定,检测质控非常重要。对于诊断有帮助,但对随访价值不如神经精神异常评估。 5、要除外其他可能的脑病原因,如代谢、感染、脑实质病变等。 polanyi 丁香园荣誉会员 -------------------------------------------------------------------- 血氨在应激状态下应该不会,尤其在肝功能尚可代偿的条件下,血氨的清除还是很迅速的。 xiule 修乐 丁香园准中级站友 --------------------------------------------------------------------- 血氨在肝性脑病病人的诊断中并不是一个很好的诊断方法。有研究指出,并不是每位病人的血氨水平都升高;经过治疗,血氨降低,病人的情况也并不见得好转。 littleboy 丁香园准中级站友 --------------------------------------------------------------------- 个人认为血氨对HE没有多少价值,临床肝硬化患者血氨与HE的相关性不是很好。但是我们可以认为血氨升高可能会影响脑细胞代谢而引起脑功能障碍,不过不一定是肝源性的血氨升高。 孤独求教 -------------------------------------------------------------------- 肝昏迷一定要有肝病基础,血氨不能作为确诊依据。 zl9841 -------------------------------------------------------------------- 同意孤独的意见。 fdj0289 ------------------------------------------------------------------- 肝功能正常并能完全排除HE,尤其该患有血氨异常,请注意有无特发的门体分流情况。 wolf7174 我们科有许多的肝性脑病的病人,血氨并不升高,但患者出现脑病症状,经治疗后症状好转,血氨有时可有所上升。我个人认为血氨对肝性脑病无诊断意义。

⑺ ppd试验是什么

结核菌素试验又称PPD试验,是指通过皮内注射结核菌素,并根据注射部位的皮肤状况诊断结核杆菌感染所致Ⅳ型超敏反应的皮内试验。

结核菌素是结核杆菌的菌体成分,包括纯蛋白衍生物(PPD)和旧结核菌素(OT)。该试验对诊断结核病和测定机体非特异性细胞免疫功能有参考意义。

常用皮内注射法,常规消毒后将试验液注射于前臂屈侧皮内,48~72小时观察结果,如48小时结果看不清,应以72小时的结果为准,注意局部有无硬结,不可单独以红晕为标准。

图为结核菌素试验诱发bazin硬红斑

(7)数据连接试验是诊断什么病扩展阅读:

在学校的健康体检中,经常会遇到结核菌素试验(PPD试验),结核菌素皮肤试验(PPD试验)是测定是否感染结核菌的一种传统方法,是结核病筛查的主要手段,也是目前世界卫生组织推荐发展中国家优先使用的结核病筛查方法。

其中,PPD是结核菌素纯蛋白衍生物的缩写,是从结核杆菌培养、滤液中获得的活性物质,其主要成分是蛋白质,对已受结核菌感染或曾接受过卡介苗免疫的机体,能引起特异的皮肤变态反应。

参考资料:网络—结核菌素试验

参考资料:人民健康网—学生体检,做结核菌素试验有必要吗

⑻ ELISA实验数据处理方法是怎样的

ELISA试剂盒在国内有许多种叫法:例如:ELISA检测试剂盒、ELISA?Kit、酶联免疫试剂盒、酶联免疫吸附测定试剂盒、酶联免疫分析试剂盒、酶免试剂盒等,比较常见的叫法是ELISA检测试剂盒、酶联免疫吸附测定试剂盒等?ELISA试剂盒自从60-70年代问世以来,得到全世界科研工作者的认可及推崇,在欧美及中国获得很大的推广,尤其是国内生化领域的长足发展。Elisa生物试验是一种敏感性高,特异性强,重复性好的实验诊断方法。由于其试剂稳定、易保存,操作简便,结果判断较客观等因素,已广泛应用在免疫学检验的各领域中。本章交流分享:ELISA实验数据处理方法是怎样的?想要了解的同学欢迎来电咨询。
1、拟和曲线:
输入行: 浓度值, 如0 10 50 100
输入第二行:该浓度下的调整后的od值,如0 0.586 1.397 1.997 3.42
选择这些输入的数据,用插入里的图表按钮,进入图表向导,在“标准类型”中选择“xy散点图”;在“子图表类型”中选择“折线散点图”,按“下一步”;选择“系列产生在行”,按“下一步”;数据标志,可以填写:如数据y轴,OD值;数据x轴,浓度;按下一步,点击完成。可得曲线图。
单击曲线,按右键,选择“添加趋势线”,在类型中,选择多项式;在选项中,选择显示公式,选择显示R平方值。
得到公式和R平方值。
也可以用上面说的方法:双击图表,把它输入到图表的数据中,就可以拟和曲线。
2、计算浓度:
次实验:
标准曲线为:
y = -4E-05x2 + 0.026x
R2 = 0.9745
为例,已知OD值,计算浓度。
由于y = -4E-05x2 + 0.026x,所以可以得到:
4E-05x2 -0.026x +y=0
ax2 +bx +y=0
a=4E-05;b=-0.026;
x=(-b-(b*b-4ay)(平方根))/(2*a)
代入a,b,和y值,得
x=(0.026-(0.026*0.026-0.00016*y)(平方根))/(2*0.00004)
在excel里可以用以下公式表示:
x=(0.026-EXP(LN(0.026*0.026-0.00016*y)/2))/(2*0.00004)
通用公式为:
x=(-b-EXP(LN(b*b-4ay)/2))/(2*a)
应用excel的公式拷贝功能,计算所有浓度

⑼ 结核菌素皮肤试验强阳性是怎么回事

结核菌素试验强阳性通常提示体内有活动性的肺结核存在;但该项检查并不能作为结核病的确诊标准,也有可能是刚注射了卡介苗后的反应,或者是既往感染过结核菌。还是要进一步检查明确诊断,尤其是痰涂片检查,能更准确反应有无肺结核以及有无传染性、传染性高低结核菌素试验强阳性,说明新近有结核菌感染,在未来半年到一年的时间内有一定的发病风险。如果近期有肺结核患者的密切接触史,可以在知情同意自愿的前提下进行抗结核预防性治疗。也可以在接下来的3个月,6个月和12个月的时间截点进行胸部影像学检查。单纯ppd强阳性,影像学拍片或者ct检查正常,只能说结核菌感染,并不是肺结核病人。
硬结平均直径在5mm或5mm以上者为阳性,5-9mm为一般阳性,10-19mm为中度阳性,20mm以上局部有水泡,出血、坏死及淋巴管炎者均为强阳性。如结核菌素试验阳性时,表明体内已感染过结核菌,一般在接种卡介苗3个月以后结核菌素试验阳性.作皮试呈强阳性者,常提示体内有活动性结核灶。建议到结核医院进行确诊,确诊后按疗程系统用药。
建议您到传染病院或是正规医院复查胸片或是肺部CT,痰涂片查找结核杆菌以及再次进行PPD试验。已确诊有无结核,另外需要排除肺部以外的结核。确诊后可以用异烟肼,利福平等正规治疗

⑽ Genome medicine :经过验证的单细胞在复杂疾病的诊断和治疗靶标的策略

        1.1 基因组医学为鉴定复杂疾病的生物标志物和可治疗靶标铺平了道路,单细胞RNA测序研究(scRNA-seq)可以表征整个器官中的此类复杂变化。取而代之的是,在多个细胞类型的多个因果机制的分散体是通过其他一些研究。这种复杂性的一个极端后果是可能需要大量的药物才能有效治疗每种疾病。为了解决这个问题,我们理想地需要表征所有与疾病相关的细胞类型和途径,然后优先确定相对最重要的细胞。据我们所知,这两个挑战都没有得到系统解决。一个原因是患者可能无法获得许多细胞类型,另一个原因是缺乏在细胞类型和途径之间进行优先排序的方法。

        1.2 作者的策略的普遍适用性通过对151例患有13种自身免疫性,过敏性,感染性,恶性,内分泌性,代谢性和心血管性疾病以及53个年龄和性别匹配的对照的患者进行的前瞻性诊断研究得到了支持。该策略的治疗潜力得到了对这些疾病的基于网络的分析以及对关节炎小鼠模型的研究的支持。综上所述,作者的结果支持我们的策略可能具有优先考虑复杂疾病中治疗和诊断目标的潜力。

        2.1 试验设计

        2.1.1总而言之,本研究描述了构建MCDM并将其用于诊断和治疗的可扩展的分步策略。该策略已通过临床和实验研究验证。该策略基于应用网络工具来组织和分析来自关节炎和人类类风湿性关节炎小鼠模型的scRNA-seq数据。使用来自13种疾病的前瞻性临床研究的表达谱数据和潜在的蛋白质生物标记物进行诊断验证研究。通过对关节炎小鼠模型的治疗研究,使用表型,免疫组织化学和细胞分析作为读数,检查了候选药物。

        2.1.2 类风湿关节炎小鼠模型

        使用bcl2fastq Conversion和Picard软件将单细胞数据处理为数字基因表达矩阵。从GRCh38(2017年4月,Ensembl)获取用于人类数据(和GRCm38(2017年6月,Ensembl)用于小鼠的读数的索引参考。使用STAR软件获取数据。根据使用STAR软件的作图质量,在下游分析期间仅考虑了与参考基因组的初步比对。通过每个细胞至少有10,000个读数,400个转录本和少于20%的线粒体基因来评估细胞的质量。由于存在文库重复的风险,导致两个或更多细胞共享细胞条形码,因此,基于对转录物计数的高估,可以移除异常值。结果分别获得了7086和1333个细胞用于关节和淋巴结数据。然后使用Seurat [34]将单细胞数据归一化以进行进一步分析。为了减少数据中的噪声,对每个组织矩阵分别进行K最近邻平滑处理,至少使用5个k,或者如果捕获到5000个以上的单元,则要占单元总数的〜0.1%。

3.1 抗原诱导性关节炎(AIA)小鼠模型的scRNA-seq分析

a  AIA鼠标模型的概述。 b 苏木精和曙红(H&E)染色后,来自幼稚小鼠和关节炎关节的代表性关节图像。B,骨髓;S,滑膜腔;C,软骨。箭头指示(1)炎性细胞向滑膜的浸润,(2)软骨/骨破坏,和(3)滑膜内膜的增生。 c 使用参考成分分析(RCA)对seq-well scRNA-seq和细胞类型进行鉴定的示意图。 d  t-SNE图显示7086个健康和RA关节细胞( n  = 4个健康小鼠样品和5个患病小鼠样品)以及1333个健康和AIA淋巴结细胞( n  = 4个健康小鼠样品和5个患病小鼠样品),由RCA簇着色

3.1来自AIA小鼠模型的多细胞疾病模型(MCDM)

    通过将每种细胞类型中差异表达的基因与所有其他细胞类型中预测的上游调节子相连接,基于scRNA-seq数据构建MCDM。像元类型大小对应于中心性得分。节点指示的数字表示已识别的特定类型的细胞数(例如,在RA关节中,我们已识别出4258个粒细胞)。 一个 从关节炎小鼠的淋巴结的MCDM。 b 来自关节炎关节的MCDM。 c 健康小鼠关节的多细胞模型(未显示淋巴结模型,因为只有一种预测的相互作用)。预测的上游调节子的基因名称显示在箭头上。Treg,T调节细胞。 d  细胞类型的中心性评分与通过GWAS鉴定的具有遗传变异的基因的富集和差异表达基因之间专家管理的存储库之间的相关性(这些基因来自DisGeNet并基于人类基因的小鼠直向同源物进行了分析)

 3.3疾病相关细胞类型的网络模型

     a 24个细胞类型和亚群均显着富集与RA相关GWAS富集后生标记。像元类型大小对应于关联-ln( p 值)。 b 与类风湿关节炎(RA)相关的细胞类型的网络模型。节点对应于细胞类型,节点大小对应于关联的重要性(-log10 RA GWAS-表观遗传标记富集 p 值)。具有潜在空间相互作用的单元格类型被链接在一起,并且单元格类型的位置取决于中心得分,如背景中的圆环所示。 C 按与175种人类疾病的关联的重要性排序的细胞类型类别的条形图(Fisher结合了富含GWAS的表观遗传标记–为每种细胞类型类别计算的疾病关联 p 值)。 d 基于与 b中 相同的参数的与175种疾病相关的细胞类型的网络模型(有关详细信息,请参阅 结果 )

3.4根据13种疾病的临床概况研究,CD4 + T细胞具有诊断潜力。

    疾病模块 的 玩具模型。疾病相关基因(红色)被映射到人蛋白质-蛋白质相互作用网络中的蛋白质(蓝色)上。共定位的疾病相关基因形成一个模块。 b 基于模块的分析概述。第一步是在前瞻性CD4 + T细胞微阵列研究中确定的13种疾病中的每一种的疾病模块的识别。对于每种疾病模块,基因将患者与健康对照区分开。为了成对比较疾病,将两个模块的结合中的基因分开患有不同疾病的患者。例如,流感和哮喘模块中的基因将流感患者与患有AUC为0.99的哮喘患者区分开, p  = 3.3×10 -5,如 c 所示。 c 使用弹性网基于模块相交基因在13种疾病分类的曲线下面积(AUC)值上显示热图。 d  基于在CD4 + T细胞中测得的预先选择的生物标志物(基因),对乳腺癌患者( n  = 24)和健康受试者( n  = 14)的分类准确性进行的独立验证研究。用弹性网进行分类,保留与原始研究相同的λ( λ )值。 e  –  j 根据在溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)模块相交处鉴定出的六种分泌血浆蛋白,对IBD患者进行潜在的诊断分类。这些蛋白质可以将患者与健康对照(HCs)分开。 e  CXCL11;  f  CCL25; g  CXCL1;  h  CXCL8; i  IL1B; Ĵ  TNF。 k 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者根据CXCL1和CXCL8的标准化蛋白质水平进行分类。UC,溃疡性结肠炎;CD,克罗恩病;HC,健康对照。星号表示 p 值<0.05。 d  –  k 方框中的条形图代表中位数,第25和第75个百分位数,而晶须延伸到±  2.7σ (请参见“ 方法 ”部分)

3.5苯扎贝特可预防抗原诱发的关节炎(AIA)

    用苯扎贝特( n  = 4)或模拟(AIA对照, n  = 5)腹膜内(ip)治疗mBSA诱导的关节炎的雌性小鼠。 一个 基于在两个组的组织病理学第28天的关节炎严重性评分(H&E染色,垂直条表示中值,使用曼-惠特尼评估组间差异的 ü 测试,*  p  <0.05)。 b 来自苯扎贝特治疗的小鼠的代表性H&E联合图像。 c 从模拟(AIA对照, n  = 5)或苯扎贝特治疗( n )分离的脾和淋巴结细胞中,CD4 +辅助性T细胞的抗原召回反应 = 4)小鼠;竖线表示平均值±SEM,使用双面Mann-Whitney  U 检验评估的组间差异*  p  <0.05)

        4.1由于成千上万的基因参与了许多不同的细胞类型,因此了解复杂疾病中的致病机制和确定药物靶标是一项艰巨的挑战。诸如GWAS和scRNA-seq等无偏倚的全基因组方法表明,多种致病机制分散在许多细胞类型中。

        4.2药物发现的困难以及为什么许多患者对治疗无反应。尽管如此,疾病相关细胞类型的系统表征和优先级以及用于诊断和治疗的机制仍未解决。一种明显的方法是识别并确定最重要的途径。在作者对AIA的scRNA-seq研究中,发现涉及T细胞分化的途径最为重要。这与对RA发病机理的当前理解是一致的,并已导致靶向此类途径的药物。但是,效果是可变的。作者对scRNA-seq数据的系统分析提出了一种可能的解释,该数据揭示了每种细胞类型中的大量其他途径和治疗靶标,以及细胞类型之间的重叠有限。

        4.3结果支持基于网络的原理可以同时应用于两者。将来自AIA和人类RA的scRNA-seq数据整理成MCDM。取代任何具有明显关键调节作用的独特细胞类型或机制,MCDM中的大多数细胞类型都相互作用,形成了多向网络,其中多种细胞类型可能导致了发病机理。尽管一种细胞类型和机制可能发挥关键作用,但对遗传和表观遗传学数据的分析支持致病机制分散在多种细胞类型中。

     4.4作者发现支持MCDM和网络原理可能具有优先考虑细胞类型以及生物标志物和药物发现机制的潜力。提供了所有提供的数据和方法以促进此类研究。

-----在读博士,代谢,组学研究 王平写作

Gawel, Danuta R et al. “A validated single-cell-based strategy to identify diagnostic and therapeutic targets in complex diseases.”  Genome medicine  vol. 11,1 47. 30 Jul. 2019, doi:10.1186/s13073-019-0657-3

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