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數據連接試驗是診斷什麼病

發布時間:2022-10-01 19:34:31

⑴ 診斷是否是肺結核,有哪些快速的方法

我是從事公共衛生方向的醫生,我來回答一下。結核病是由結核分枝桿菌引起的慢性傳染病,可侵及全身除牙齒和頭發以外的所有內臟,以結核病最為常見。人體感染結核病後,不一定會發病。據估計,目前我國攜帶結核桿菌的細菌數量約為5億左右。結核桿菌是一種機會性致病菌,在人體免疫功能正常的情況下,不會引起人體疾病。




肺結核作為一種傳染病,主要通過空氣傳播,所以肺結核患者應戴口罩,同時也要注意與肺結核患者接觸。結核病是一種機會性疾病,與人體的免疫狀態密切相關,所以我們應該多鍛煉身體,多做一些有助於提高免疫力的事情。這就是我的回答,謝謝大家! 如果您有任何問題,請留言。您也可以關注私信咨詢,謝謝!


小編針對問題做得詳細解讀,希望對大家有所幫助,如果還有什麼問題可以在評論區給我留言,大家可以多多和我評論,如果哪裡有不對的地方,大家也可以多多和我互動交流,如果大家喜歡作者,大家也可以關注我哦,您的點贊是對我最大的幫助,謝謝大家了。

⑵ 診斷試驗的聯合應用有幾種方法,不同方法對試驗的真實性和預測值有何影響

  1. 真實性(validity)或准確性(accuracy)要求一項診斷試驗具備能正確地鑒別某病例患和未患某病的能力。這種反映患病實際情況的程度稱作真實性,亦稱准確性。

  2. 2.可靠性(reliabiliy)、重復性(repeatability)或精密度(precision)是指一項診斷試驗在完全相同的條件下,重復作時獲得相同結果的穩定程度。在臨床實踐中,一般用符合率來表示可靠性。

  3. 3.預測值(predictive value)靈敏度和特異度是一項診斷試驗的特徵,在決定是否採用某項試驗時應考慮這些特徵。一旦採用了某項診斷試驗,就要仔細考慮試驗結果的意義。如獲陽性結果,患某病的可能性是多少;若獲陰性結果,未患某病的可能性是怎樣?這就是預測值。陽性預測值是指試驗陽性的病例中真陽性的比例;陰性預測值是指試驗陰性的病例中真陰性的比例。

⑶ 簡述診斷試驗評價的主要指標。

診斷試驗評價的主要指標有敏感度(Sen)、特異度(Spe)、誤診率、陽性預測值、陰性預測值、假陰性率、假陽性率、似然比、符合率、准確度。
診斷試驗是主要應用於疾病診斷、疾病隨訪、療效考核以及葯物毒副作用的監測。臨床醫師但單憑經驗難免不夠穩妥診斷,如未能給患者及時有效的治療,甚至造成不可彌補的損失。掌握科學的研究和評價診斷試驗的方法可為其選擇合理的診斷方法奠定基礎,同時可避免單憑經驗造成的錯誤。

2研究方法編輯
1須同標准診斷方法(金標准,gold standard) 進行盲法比較。標准診斷方法是指可靠的,公認的診斷方法,它能正確地區分有病和無病。臨床上常用的標准診斷方法包括病理學檢查,外科手術所見以及長期隨訪病例所獲得的肯定結論。例如,診斷冠心病的標准診斷方法是冠狀動脈造影,診斷腎炎的標准方法是腎組織活檢和屍體解剖,診斷膽結石的標准方法是手術所見。具體作法是運用標准診斷方法,在「盲」的條件下將病例區分為實際有病和無病兩組,再將待評價的診斷試驗與相同病例診斷的結果作比較,然後列出四格表,就可得出真假陽性和真假陰性的結果,如表33-1所示,並計算靈敏度、特異度、預測值和正確指數等。
公式
2.被檢查的病例要具備代表性,即要包括各臨床型(輕、中、重型;有或無並發症者)病例。病例的代表性愈好,新的診斷試驗的實用價值愈大。

3.選擇對照。對照應在性別、年齡、某些生理狀態等方面與病例保持均衡。對照不應只包括健康人,還應包括確實未患該病的其他病例以及確實未患該病但在臨床上極易與該病混淆的其他病病例。

4.確定正常值。正常值的含義應說清,否則會直接影響正常值的數據。在正態分布時,正常值可用平均數±2SD表示。非正態分布時可用中位數或百分位數表示。繪制患病人群與未患人群診斷試驗測定值的頻數分布曲線時常有重疊。區別正常與異常的界限是否是最佳的臨界點,將對診斷試驗的靈敏度和特異度產生明顯的影響。

5.要說明病例的來源。不同來源的病例對評價一項診斷試驗有一定影響。這是由於不同人群某病患病率的差異對陽性預測值有影響。同時,對照的來源也應交待清楚。

⑷ ppd試驗是什麼

ppd試驗是臨床確診結核病的重要指標。
對於不同的人群有不同的意義
(1)嬰幼兒:常用於卡介苗接種的選擇和監測。陽性時常表示已感染結核菌並產生抗體而不需要接種卡介苗;陰性時則應該及時接種卡介苗。未接種卡介苗的兒童,如果皮試呈強陽性時常表示體內有活動性結核灶,應及時進行結核菌檢查、影像學檢查、血沉等檢查以確定診斷和治療。
(2)成年人:因我國城鎮中人口密集區成年居民的結核感染率很高,所以,如果ppd5單位試驗陽性,僅表示有結核感染,並不一定患病;但呈強陽性時,常提示有活動性結核灶。因此,tb—ppd試驗在診斷成人結核性疾病時診斷價值受限。
另外,在臨床上有感染結核的確切依據而患者ppd試驗卻陰性,這種情況常見於以下疾病:初次感染結核菌4~8周以內、重度營養不良、惡性腫瘤、機體免疫缺陷性疾病(先天性免疫缺陷症、艾滋病)、免疫抑制劑使用者等,個別老年人因機體變態反應功能低下也常呈陰性反應。

⑸ 判斷「糖尿病」, 看一下這個檢測報告是否有糖尿病。請各位大俠

糖尿病的診斷標准:
正常空腹血糖的范圍為3.15~6.19mmol/L,餐後血糖2小時血糖<7.8mmol/L,當空腹血糖≥7.0mmol/L,餐後2小時血糖≥11.1mmol/L為糖尿病;如果空腹血糖在6.1mmol/L~7.0mmol/L則稱為空腹血糖損害。如果空腹血糖正常,餐後血糖在7.8mmol/L~11.1mmol/L則稱為糖耐量減低。空腹血糖損害與糖耐量減低可看做從正常到糖尿病的一個過渡階段,但如果治療得當,可以逆轉為正常。如果治療不得當,則發展為糖尿病。
人體血糖正常濃度為:空腹靜脈血漿血糖3.9~6.0mmol/L,餐後靜脈血漿血糖<7.8mmol/L。
糖化血紅蛋白的正常值是小於6.5%。糖化血紅蛋白正常值:4.6~6.4。
葡萄糖耐量試驗及饅頭餐試驗診斷糖尿病的標准:空腹血糖≥7.0mmol/L,2小時血糖≥11.1mmol/L,或任何時間的血糖≥11.1mmol/L,可以診斷為糖尿病。
有點重了,還有點並發症口渴、消瘦無力。只能怪你爸爸沒有引起重視。現在後悔了。
糖尿病食譜
體重正常,無任何並發症者,從事重體力勞動,每日主食可適當放寬到300克(乾的,指的是未煮熟的)以上。
兒童、孕婦、哺乳期婦女和營養不良者,主食250~300克。肉蛋類可增加至200~300克,烹調油40克,每日雞蛋一個,牛奶250毫升或更多些。
肥胖伴有輕度並發症者或老年者,日主食限定在200~250克以內,蔬菜400~500克,肉蛋105克,烹調油30克。
經常吃點粗糧,最好是燕麥、蕎麥、麩皮.多食用苦瓜。葷菜每餐100克(帶骨)。保證每天的攝入營養夠就行,適當多吃點蔬菜可充飢。
吃蔬菜吃闊葉類比小葉類好,小葉類的蔬菜比莖塊類的蔬菜好,薯類(如山芋)要少吃,吃的話要適當減少主食。
吃葷菜吃兩條腿(雞)比四條腿(豬)的好,含脂肪少,沒有腿的(魚)比兩條腿的(雞)好。
加餐的話,在兩餐之間,上午9點左右,下午4點左右。可用黃瓜、蕃茄,(可當水果吃)無糖餅干或不加糖餅干。
如果血糖控製得比較理想,穩定而無波動,空腹血糖控制在7.8mmol/L以下,飯後兩小時血糖控制在10.0mmol/L以下,糖化血紅蛋白在7.5%以下時,完全可以進食所喜歡的美味水果。飯後4小時吃點含糖量低的水果,有柚子、檸檬、西瓜、桃子、梨子、草莓、蘋果。每人每天500克的蔬菜和水果,蔬菜400克,水果100克。100克蘋果或橘子相當於12.5克主食.應從主食中減去12.5克.水果的重量包括與核的重量。如果每天吃200克的蘋果,所產生的熱量相當於吃主食的25克。
膽固醇的需要量,每人每天小於300毫克。一個雞蛋的蛋黃剛好含有近300毫克膽固醇。所以每人一天吃一個雞蛋蛋黃,正合乎營養要求。20粒花生米,40粒瓜子或是2顆核桃,就相當於10克純油脂。吃了75克魚肉就等於吃了25克瘦豬肉。200克的桃,相當於25克糧食產生的熱能量。
飯菜一定要以清淡為主,少吃或不吃肥肉。每月每人的植物油用量,應限制在400—600克左右。
要控制血糖,必須控制飲食,堅持鍛煉身體, 每天服葯,定期監測血糖 ,並保持良好的心態,避免情緒有大的波動。
理想體重(公斤)=身高(厘米)-105。實際體重超過理想體重的10%就算超重。體重應控制在理想體重的±10%以內。
一般飯後1小時後運動為最佳。肥胖患者體重減輕的速度以每月體重下降1公斤左右為宜。
輕微強度的運動項目有:散步、站立乘車、簡單的家務勞動持續30分鍾左右。
步行、洗澡、下樓梯、做廣播體操、平地騎自行車等,持續20分鍾左右。這種強度的運動和持續時間,相當於消耗80千卡的熱量。
中等強度的運動有:慢跑、上樓梯、坡路騎自行車、滑冰、打排球、登山等。持續10分左右。能消耗體內的熱能80千卡。
大強度的運動有:長跑、跳繩、打籃球、舉重、擊劍等能持續5分鍾左右,相當於消耗體內熱量80千卡。
每天運動至少要消耗160千卡的熱量,才能達到控制血糖和降低體重的目的。還要強調持之以恆。

⑹ 請教:肝昏迷的診斷標準是什麼血氨的測定在其診斷中所處的地位在應激狀態下,血氨是否會升高

在急性肝炎病情發展階段,如出現神志改變或昏迷,則診斷比較容易。如肝硬化患者有明顯肝功能失代償的症狀,或病史中有過門靜脈分流手術,或近期有上消化道大量出血、感染、大量利尿、應用麻醉鎮靜葯等誘因,肝性腦病的診斷也不難作出,此時如發現撲擊樣震顫和血氨增高,則可以肯定診斷 空腹動脈血氨比較穩定可靠,慢性肝性腦病尤其是門體分流性腦病多有血氨升高;急性肝衰竭所致的腦病,血氨多正常。 polanyi丁香園榮譽會員 -------------------------------------------------------------------- 同意kepple的意見。補充幾點: 1、所問為肝昏迷還是肝性腦病?hepatic coma和hepatic encephalopathy(HE)在概念上還是有所不同。後者大於前者,按West Haven criteria分的0-4級,若有coma,已經是4級肝性腦病。此時,按kepple所提診斷依據較好。 2、若有已知有明確肝硬化或門脈高壓及門體分流的基礎,或急性肝衰竭,加上進展性腦病表現,撲擊樣震顫陽性,肝性腦病已可臨床診斷。血氨增高有利於門體分流性HE診斷。 3、subclinical hepatic encephalopathy(SHE)在肝硬化患者中的發生率約30-84%。SHE由於通常僅有有智力檢測和誘發電位的異常,而無腦病臨床表現,常規的精神和神經功能檢查正常。因此很容易被忽略。腦誘發電位不知道你那裡有沒有做。如果沒有的話可使用一些智力測試試驗,如數字連接試驗、圖畫連接、數字元號試驗和搭積木試驗等來代替。雖然SHE還沒有統一的標准,一般來說,智力試驗及腦誘發電位中有一項以上異常者可以診斷SHE。特別要注意對有肝硬化或TIPPS等門體分流基礎的患者,若智力試驗提示異常,還是可以用乳果糖等進行試驗性治療的。 4、關於血氨測定,檢測質控非常重要。對於診斷有幫助,但對隨訪價值不如神經精神異常評估。 5、要除外其他可能的腦病原因,如代謝、感染、腦實質病變等。 polanyi 丁香園榮譽會員 -------------------------------------------------------------------- 血氨在應激狀態下應該不會,尤其在肝功能尚可代償的條件下,血氨的清除還是很迅速的。 xiule 修樂 丁香園准中級站友 --------------------------------------------------------------------- 血氨在肝性腦病病人的診斷中並不是一個很好的診斷方法。有研究指出,並不是每位病人的血氨水平都升高;經過治療,血氨降低,病人的情況也並不見得好轉。 littleboy 丁香園准中級站友 --------------------------------------------------------------------- 個人認為血氨對HE沒有多少價值,臨床肝硬化患者血氨與HE的相關性不是很好。但是我們可以認為血氨升高可能會影響腦細胞代謝而引起腦功能障礙,不過不一定是肝源性的血氨升高。 孤獨求教 -------------------------------------------------------------------- 肝昏迷一定要有肝病基礎,血氨不能作為確診依據。 zl9841 -------------------------------------------------------------------- 同意孤獨的意見。 fdj0289 ------------------------------------------------------------------- 肝功能正常並能完全排除HE,尤其該患有血氨異常,請注意有無特發的門體分流情況。 wolf7174 我們科有許多的肝性腦病的病人,血氨並不升高,但患者出現腦病症狀,經治療後症狀好轉,血氨有時可有所上升。我個人認為血氨對肝性腦病無診斷意義。

⑺ ppd試驗是什麼

結核菌素試驗又稱PPD試驗,是指通過皮內注射結核菌素,並根據注射部位的皮膚狀況診斷結核桿菌感染所致Ⅳ型超敏反應的皮內試驗。

結核菌素是結核桿菌的菌體成分,包括純蛋白衍生物(PPD)和舊結核菌素(OT)。該試驗對診斷結核病和測定機體非特異性細胞免疫功能有參考意義。

常用皮內注射法,常規消毒後將試驗液注射於前臂屈側皮內,48~72小時觀察結果,如48小時結果看不清,應以72小時的結果為准,注意局部有無硬結,不可單獨以紅暈為標准。

圖為結核菌素試驗誘發bazin硬紅斑

(7)數據連接試驗是診斷什麼病擴展閱讀:

在學校的健康體檢中,經常會遇到結核菌素試驗(PPD試驗),結核菌素皮膚試驗(PPD試驗)是測定是否感染結核菌的一種傳統方法,是結核病篩查的主要手段,也是目前世界衛生組織推薦發展中國家優先使用的結核病篩查方法。

其中,PPD是結核菌素純蛋白衍生物的縮寫,是從結核桿菌培養、濾液中獲得的活性物質,其主要成分是蛋白質,對已受結核菌感染或曾接受過卡介苗免疫的機體,能引起特異的皮膚變態反應。

參考資料:網路—結核菌素試驗

參考資料:人民健康網—學生體檢,做結核菌素試驗有必要嗎

⑻ ELISA實驗數據處理方法是怎樣的

ELISA試劑盒在國內有許多種叫法:例如:ELISA檢測試劑盒、ELISA?Kit、酶聯免疫試劑盒、酶聯免疫吸附測定試劑盒、酶聯免疫分析試劑盒、酶免試劑盒等,比較常見的叫法是ELISA檢測試劑盒、酶聯免疫吸附測定試劑盒等?ELISA試劑盒自從60-70年代問世以來,得到全世界科研工作者的認可及推崇,在歐美及中國獲得很大的推廣,尤其是國內生化領域的長足發展。Elisa生物試驗是一種敏感性高,特異性強,重復性好的實驗診斷方法。由於其試劑穩定、易保存,操作簡便,結果判斷較客觀等因素,已廣泛應用在免疫學檢驗的各領域中。本章交流分享:ELISA實驗數據處理方法是怎樣的?想要了解的同學歡迎來電咨詢。
1、擬和曲線:
輸入行: 濃度值, 如0 10 50 100
輸入第二行:該濃度下的調整後的od值,如0 0.586 1.397 1.997 3.42
選擇這些輸入的數據,用插入里的圖表按鈕,進入圖表向導,在「標准類型」中選擇「xy散點圖」;在「子圖表類型」中選擇「折線散點圖」,按「下一步」;選擇「系列產生在行」,按「下一步」;數據標志,可以填寫:如數據y軸,OD值;數據x軸,濃度;按下一步,點擊完成。可得曲線圖。
單擊曲線,按右鍵,選擇「添加趨勢線」,在類型中,選擇多項式;在選項中,選擇顯示公式,選擇顯示R平方值。
得到公式和R平方值。
也可以用上面說的方法:雙擊圖表,把它輸入到圖表的數據中,就可以擬和曲線。
2、計算濃度:
次實驗:
標准曲線為:
y = -4E-05x2 + 0.026x
R2 = 0.9745
為例,已知OD值,計算濃度。
由於y = -4E-05x2 + 0.026x,所以可以得到:
4E-05x2 -0.026x +y=0
ax2 +bx +y=0
a=4E-05;b=-0.026;
x=(-b-(b*b-4ay)(平方根))/(2*a)
代入a,b,和y值,得
x=(0.026-(0.026*0.026-0.00016*y)(平方根))/(2*0.00004)
在excel里可以用以下公式表示:
x=(0.026-EXP(LN(0.026*0.026-0.00016*y)/2))/(2*0.00004)
通用公式為:
x=(-b-EXP(LN(b*b-4ay)/2))/(2*a)
應用excel的公式拷貝功能,計算所有濃度

⑼ 結核菌素皮膚試驗強陽性是怎麼回事

結核菌素試驗強陽性通常提示體內有活動性的肺結核存在;但該項檢查並不能作為結核病的確診標准,也有可能是剛注射了卡介苗後的反應,或者是既往感染過結核菌。還是要進一步檢查明確診斷,尤其是痰塗片檢查,能更准確反應有無肺結核以及有無傳染性、傳染性高低結核菌素試驗強陽性,說明新近有結核菌感染,在未來半年到一年的時間內有一定的發病風險。如果近期有肺結核患者的密切接觸史,可以在知情同意自願的前提下進行抗結核預防性治療。也可以在接下來的3個月,6個月和12個月的時間截點進行胸部影像學檢查。單純ppd強陽性,影像學拍片或者ct檢查正常,只能說結核菌感染,並不是肺結核病人。
硬結平均直徑在5mm或5mm以上者為陽性,5-9mm為一般陽性,10-19mm為中度陽性,20mm以上局部有水泡,出血、壞死及淋巴管炎者均為強陽性。如結核菌素試驗陽性時,表明體內已感染過結核菌,一般在接種卡介苗3個月以後結核菌素試驗陽性.作皮試呈強陽性者,常提示體內有活動性結核灶。建議到結核醫院進行確診,確診後按療程系統用葯。
建議您到傳染病院或是正規醫院復查胸片或是肺部CT,痰塗片查找結核桿菌以及再次進行PPD試驗。已確診有無結核,另外需要排除肺部以外的結核。確診後可以用異煙肼,利福平等正規治療

⑽ Genome medicine :經過驗證的單細胞在復雜疾病的診斷和治療靶標的策略

        1.1 基因組醫學為鑒定復雜疾病的生物標志物和可治療靶標鋪平了道路,單細胞RNA測序研究(scRNA-seq)可以表徵整個器官中的此類復雜變化。取而代之的是,在多個細胞類型的多個因果機制的分散體是通過其他一些研究。這種復雜性的一個極端後果是可能需要大量的葯物才能有效治療每種疾病。為了解決這個問題,我們理想地需要表徵所有與疾病相關的細胞類型和途徑,然後優先確定相對最重要的細胞。據我們所知,這兩個挑戰都沒有得到系統解決。一個原因是患者可能無法獲得許多細胞類型,另一個原因是缺乏在細胞類型和途徑之間進行優先排序的方法。

        1.2 作者的策略的普遍適用性通過對151例患有13種自身免疫性,過敏性,感染性,惡性,內分泌性,代謝性和心血管性疾病以及53個年齡和性別匹配的對照的患者進行的前瞻性診斷研究得到了支持。該策略的治療潛力得到了對這些疾病的基於網路的分析以及對關節炎小鼠模型的研究的支持。綜上所述,作者的結果支持我們的策略可能具有優先考慮復雜疾病中治療和診斷目標的潛力。

        2.1 試驗設計

        2.1.1總而言之,本研究描述了構建MCDM並將其用於診斷和治療的可擴展的分步策略。該策略已通過臨床和實驗研究驗證。該策略基於應用網路工具來組織和分析來自關節炎和人類類風濕性關節炎小鼠模型的scRNA-seq數據。使用來自13種疾病的前瞻性臨床研究的表達譜數據和潛在的蛋白質生物標記物進行診斷驗證研究。通過對關節炎小鼠模型的治療研究,使用表型,免疫組織化學和細胞分析作為讀數,檢查了候選葯物。

        2.1.2 類風濕關節炎小鼠模型

        使用bcl2fastq Conversion和Picard軟體將單細胞數據處理為數字基因表達矩陣。從GRCh38(2017年4月,Ensembl)獲取用於人類數據(和GRCm38(2017年6月,Ensembl)用於小鼠的讀數的索引參考。使用STAR軟體獲取數據。根據使用STAR軟體的作圖質量,在下游分析期間僅考慮了與參考基因組的初步比對。通過每個細胞至少有10,000個讀數,400個轉錄本和少於20%的線粒體基因來評估細胞的質量。由於存在文庫重復的風險,導致兩個或更多細胞共享細胞條形碼,因此,基於對轉錄物計數的高估,可以移除異常值。結果分別獲得了7086和1333個細胞用於關節和淋巴結數據。然後使用Seurat [34]將單細胞數據歸一化以進行進一步分析。為了減少數據中的雜訊,對每個組織矩陣分別進行K最近鄰平滑處理,至少使用5個k,或者如果捕獲到5000個以上的單元,則要佔單元總數的〜0.1%。

3.1 抗原誘導性關節炎(AIA)小鼠模型的scRNA-seq分析

a  AIA滑鼠模型的概述。 b 蘇木精和曙紅(H&E)染色後,來自幼稚小鼠和關節炎關節的代表性關節圖像。B,骨髓;S,滑膜腔;C,軟骨。箭頭指示(1)炎性細胞向滑膜的浸潤,(2)軟骨/骨破壞,和(3)滑膜內膜的增生。 c 使用參考成分分析(RCA)對seq-well scRNA-seq和細胞類型進行鑒定的示意圖。 d  t-SNE圖顯示7086個健康和RA關節細胞( n  = 4個健康小鼠樣品和5個患病小鼠樣品)以及1333個健康和AIA淋巴結細胞( n  = 4個健康小鼠樣品和5個患病小鼠樣品),由RCA簇著色

3.1來自AIA小鼠模型的多細胞疾病模型(MCDM)

    通過將每種細胞類型中差異表達的基因與所有其他細胞類型中預測的上游調節子相連接,基於scRNA-seq數據構建MCDM。像元類型大小對應於中心性得分。節點指示的數字表示已識別的特定類型的細胞數(例如,在RA關節中,我們已識別出4258個粒細胞)。 一個 從關節炎小鼠的淋巴結的MCDM。 b 來自關節炎關節的MCDM。 c 健康小鼠關節的多細胞模型(未顯示淋巴結模型,因為只有一種預測的相互作用)。預測的上游調節子的基因名稱顯示在箭頭上。Treg,T調節細胞。 d  細胞類型的中心性評分與通過GWAS鑒定的具有遺傳變異的基因的富集和差異表達基因之間專家管理的存儲庫之間的相關性(這些基因來自DisGeNet並基於人類基因的小鼠直向同源物進行了分析)

 3.3疾病相關細胞類型的網路模型

     a 24個細胞類型和亞群均顯著富集與RA相關GWAS富集後生標記。像元類型大小對應於關聯-ln( p 值)。 b 與類風濕關節炎(RA)相關的細胞類型的網路模型。節點對應於細胞類型,節點大小對應於關聯的重要性(-log10 RA GWAS-表觀遺傳標記富集 p 值)。具有潛在空間相互作用的單元格類型被鏈接在一起,並且單元格類型的位置取決於中心得分,如背景中的圓環所示。 C 按與175種人類疾病的關聯的重要性排序的細胞類型類別的條形圖(Fisher結合了富含GWAS的表觀遺傳標記–為每種細胞類型類別計算的疾病關聯 p 值)。 d 基於與 b中 相同的參數的與175種疾病相關的細胞類型的網路模型(有關詳細信息,請參閱 結果 )

3.4根據13種疾病的臨床概況研究,CD4 + T細胞具有診斷潛力。

    疾病模塊 的 玩具模型。疾病相關基因(紅色)被映射到人蛋白質-蛋白質相互作用網路中的蛋白質(藍色)上。共定位的疾病相關基因形成一個模塊。 b 基於模塊的分析概述。第一步是在前瞻性CD4 + T細胞微陣列研究中確定的13種疾病中的每一種的疾病模塊的識別。對於每種疾病模塊,基因將患者與健康對照區分開。為了成對比較疾病,將兩個模塊的結合中的基因分開患有不同疾病的患者。例如,流感和哮喘模塊中的基因將流感患者與患有AUC為0.99的哮喘患者區分開, p  = 3.3×10 -5,如 c 所示。 c 使用彈性網基於模塊相交基因在13種疾病分類的曲線下面積(AUC)值上顯示熱圖。 d  基於在CD4 + T細胞中測得的預先選擇的生物標志物(基因),對乳腺癌患者( n  = 24)和健康受試者( n  = 14)的分類准確性進行的獨立驗證研究。用彈性網進行分類,保留與原始研究相同的λ( λ )值。 e  –  j 根據在潰瘍性結腸炎(UC)和克羅恩病(CD)模塊相交處鑒定出的六種分泌血漿蛋白,對IBD患者進行潛在的診斷分類。這些蛋白質可以將患者與健康對照(HCs)分開。 e  CXCL11;  f  CCL25; g  CXCL1;  h  CXCL8; i  IL1B; Ĵ  TNF。 k 克羅恩病和潰瘍性結腸炎患者根據CXCL1和CXCL8的標准化蛋白質水平進行分類。UC,潰瘍性結腸炎;CD,克羅恩病;HC,健康對照。星號表示 p 值<0.05。 d  –  k 方框中的條形圖代表中位數,第25和第75個百分位數,而晶須延伸到±  2.7σ (請參見「 方法 」部分)

3.5苯扎貝特可預防抗原誘發的關節炎(AIA)

    用苯扎貝特( n  = 4)或模擬(AIA對照, n  = 5)腹膜內(ip)治療mBSA誘導的關節炎的雌性小鼠。 一個 基於在兩個組的組織病理學第28天的關節炎嚴重性評分(H&E染色,垂直條表示中值,使用曼-惠特尼評估組間差異的 ü 測試,*  p  <0.05)。 b 來自苯扎貝特治療的小鼠的代表性H&E聯合圖像。 c 從模擬(AIA對照, n  = 5)或苯扎貝特治療( n )分離的脾和淋巴結細胞中,CD4 +輔助性T細胞的抗原召回反應 = 4)小鼠;豎線表示平均值±SEM,使用雙面Mann-Whitney  U 檢驗評估的組間差異*  p  <0.05)

        4.1由於成千上萬的基因參與了許多不同的細胞類型,因此了解復雜疾病中的致病機制和確定葯物靶標是一項艱巨的挑戰。諸如GWAS和scRNA-seq等無偏倚的全基因組方法表明,多種致病機制分散在許多細胞類型中。

        4.2葯物發現的困難以及為什麼許多患者對治療無反應。盡管如此,疾病相關細胞類型的系統表徵和優先順序以及用於診斷和治療的機制仍未解決。一種明顯的方法是識別並確定最重要的途徑。在作者對AIA的scRNA-seq研究中,發現涉及T細胞分化的途徑最為重要。這與對RA發病機理的當前理解是一致的,並已導致靶向此類途徑的葯物。但是,效果是可變的。作者對scRNA-seq數據的系統分析提出了一種可能的解釋,該數據揭示了每種細胞類型中的大量其他途徑和治療靶標,以及細胞類型之間的重疊有限。

        4.3結果支持基於網路的原理可以同時應用於兩者。將來自AIA和人類RA的scRNA-seq數據整理成MCDM。取代任何具有明顯關鍵調節作用的獨特細胞類型或機制,MCDM中的大多數細胞類型都相互作用,形成了多向網路,其中多種細胞類型可能導致了發病機理。盡管一種細胞類型和機制可能發揮關鍵作用,但對遺傳和表觀遺傳學數據的分析支持致病機制分散在多種細胞類型中。

     4.4作者發現支持MCDM和網路原理可能具有優先考慮細胞類型以及生物標志物和葯物發現機制的潛力。提供了所有提供的數據和方法以促進此類研究。

-----在讀博士,代謝,組學研究 王平寫作

Gawel, Danuta R et al. 「A validated single-cell-based strategy to identify diagnostic and therapeutic targets in complex diseases.」  Genome medicine  vol. 11,1 47. 30 Jul. 2019, doi:10.1186/s13073-019-0657-3

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與數據連接試驗是診斷什麼病相關的資料

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